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Il existe différents types de microorganismes qui peuvent être à l'origine de la dégradation des produits en entrepôt. Cependant, les bactéries causant des pourritures et les champignons causant des moisissures sont les plus communs.
Lorsqu'ils sont présents dans l'entrepôt, les microorganismes causant des pourritures et des moisissures sur les fruits ou légumes peuvent être éliminés par un plan d'assainissement adéquat. Pour qu'un plan d'assainissement soit efficace, il doit respecter certaines étapes dans un ordre précis. Ces étapes sont : le nettoyage, la désinfection, le rinçage et le séchage.
Dans ce texte, on y décrit chacune des étapes en détail.