La persistance de microorganismes pathogènes dans le sol à la suite de l'épandage dépend du contenu initial du lisier, qui est très variable. De façon générale, plus le lisier de porc est frais, plus il contient de microorganismes pathogènes. L'épandage de lisier de porc provenant d'une pré-fosse dans les cultures destinées à la consommation humaine est donc à éviter.
Le risque de contamination dépend aussi du délais entre l'épandage et la récolte des légumes. De façon générale, le respect d'un délai de 100 jours entre l'épandage de lisier de porc et la récolte réduit considérablement le risque de contamination microbienne des légumes.
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