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L'analyse du microbiome d'un sol

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POUR COMPRENDRE L'ÉTAT DE SANTÉ D'UN SOL, SA QUALITÉ, SA FERTILITÉ ET SON RISQUE D'EXPOSITION AUX MALADIES

Un simple kilo de sol agricole en santé contient des milliards d’organismes vivants regroupés sous l'appellation « microbiome ». L'analyse de ce dernier, en combinant les techniques de séquençage de très grande capacité à
des logiciels de bioinformatique performants, permet notamment :

• d'identifier des centaines de milliers de séquences d'ADN spécifiques aux organismes du sol;

• de dresser l’inventaire des organismes vivants dans un échantillon de sol;

• de déterminer la proportion de chaque organisme dans la communauté biologique du sol; et

• d'associer au sol les fonctions biologiques connues de chaque organisme.

L’analyse du microbiome du sol quantifie plusieurs indicateurs biologiques qui peuvent être combinés à des indicateurs physico-chimiques, agronomiques ou climatiques pour calculer des indices de santé, de qualité et de fertilité du sol ou de risque aux maladies.

Organisation : Institut de recherche et de développement en agroenvironnement (IRDA)
Auteur(s) : Richard Hogue, chercheur IRDA
Date de publication : 02 octobre 2019

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