Par convention, la teneur en matière organique (MO) du sol est estimée avec un facteur de conversion de 1,724 sur la teneur en carbone (C) organique, ou à l’inverse le carbone constitue 58 % de la MO. Toutefois, plusieurs facteurs peuvent affecter cette proportion, entre autres la présence de carbonates et les différentes formes de matière organique qu’on retrouve dans les différents sols du Québec. Quelques 793 échantillons de sols de l’ÉÉSSAQ ont été sélectionnés pour approfondir ces connaissances. L’analyse du rapport C total sur MO-paf se situe plus près de 0,5 que de 0,58, tels que d’autres l’ont souligné dans la littérature, mais ce rapport n’est  pas uniforme. Les sols sableux présentent un rapport C total/MO-paf plus faible que les sols argileux et tout type de sols prélevés en profondeur dans l’horizon B présente aussi un rapport C total/MO-paf plus faible que 0,5. Les résultats de ces différents essais ont mis en lumière quelques phénomènes importants à considérer lors de l'analyse du carbone dans les sols et des besoins en équipements spécialisés pour traiter des carbonates et autres formes de carbone récalcitrantes.