Depuis plus de 30 ans, Odile Carisse consacre sa carrière à protéger les cultures agricoles contre les maladies des plantes. Le travail d’Odile et de son équipe est maintenant reconnu à l’échelle internationale et aura profondément transformé les approches en matière d’agriculture durable en ce qui concerne la lutte contre les champignons. Lire la suite

Ce projet avait pour objectif d’améliorer les capacités de diagnostic et de surveillance phytosanitaire au Québec en développant des outils moléculaires innovants. Il s’est concentré sur trois complexes pathogènes majeurs : le complexe Phytophthora dans les sapins de Noël, les bactérioses de l’oignon et les formes spéciales de Fusarium oxysporum dans les cultures maraîchères. Les travaux ont permis de concevoir un test qPCR spécifique à Phytophthora abietivora et de mettre au point un outil de séquençage IonTorrent pour détecter plusieurs espèces du complexe. Un outil basé sur la technologie MinIon a également été développé pour le diagnostic des bactérioses de l’oignon. Enfin, des marqueurs PCR et qPCR ont été adaptés pour identifier différentes formae speciales de Fusarium oxysporum responsables de la fusariose dans des cultures comme la tomate, l’oignon, l’épinard, la laitue, le concombre, la fraise et le céleri. Les connaissances acquises sur la génétique de ces pathogènes ouvrent la voie à l’utilisation future des technologies de séquençage de troisième génération pour des diagnostics rapides et précis.   Lire la suite

Ce projet avait pour objectif d’améliorer les capacités de diagnostic et de surveillance phytosanitaire au Québec en développant des outils moléculaires innovants. Il s’est concentré sur trois complexes pathogènes majeurs : le complexe Phytophthora dans les sapins de Noël, les bactérioses de l’oignon et les formes spéciales de Fusarium oxysporum dans les cultures maraîchères. Les travaux ont permis de concevoir un test qPCR spécifique à Phytophthora abietivora et de mettre au point un outil de séquençage IonTorrent pour détecter plusieurs espèces du complexe. Un outil basé sur la technologie MinIon a également été développé pour le diagnostic des bactérioses de l’oignon. Enfin, des marqueurs PCR et qPCR ont été adaptés pour identifier différentes formae speciales de Fusarium oxysporum responsables de la fusariose dans des cultures comme la tomate, l’oignon, l’épinard, la laitue, le concombre, la fraise et le céleri. Les connaissances acquises sur la génétique de ces pathogènes ouvrent la voie à l’utilisation future des technologies de séquençage de troisième génération pour des diagnostics rapides et précis. Lire la suite

Ce projet a consisté à répondre à l’objectif principal qui vise à évaluer la capacité d’identifier par séquençage à haut débit (SHD) des organismes phytopathogènes bactériens et fongiques qui infectent des pommes de terre et des plantes en grandes cultures, et en cultures maraîchères.  En partenariat avec le Laboratoire d’expertise et de diagnostic en phytoprotection du MAPAQ (LEDP) et le Laboratoire de phytopathologie du CEROM, nous avons obtenu et traité des échantillons provenant de nos partenaires entre 2019 et 2022. Nous avons validé les protocoles d’extraction d’acides nucléiques nécessaires selon le type d’échantillon, développé les protocoles de séquençage haut débit sur plateforme MiSeq et MinION (Livrable L3). Au total cinq systèmes de détection ont été retenus pour l’évaluation sur MiSeq et deux systèmes sur MinION. Des tests additionnels ont également permis d’évaluer l’approche NanoMiSeq permettant de soumettre moins d’échantillons en même temps à la phase de séquençage. Cette approche sera plus adaptée au débit analytique du LEDP en saison estivale. Nous avons de plus évalué une approche de préparation de librairie en une seule étape qui permet de réduire les coûts d’opération reliés à l’analyse par SHD. Nous avons également développé un nouvel outil informatique permettant de créer des bases de références taxonomiques en regroupant des séquences de plusieurs bases de données de référence publiques et selon le système d’amplification utilisé pour le SHD. Cet outil (ASVMaker) a été publié dans la revue « Plants » (Annexe 2-4). La base de données taxonomiques de référence spécifiques produite avec cet outil s’intègre dans notre stratégie de double identification (application pour les données obtenues par MiSeq et NanoMiSeq) Nos résultats montrent un fort potentiel des approches SHD pour identifier les genres pathogéniques ciblés (Livrable L2). Pour certains d’entre eux (essentiellement des genres fongiques), il est possible d’identifier des Lire la suite

Cette revue de littérature se positionne dans un contexte où les fongicides chimiques, malgré les efforts pour en réduire l'usage, restent centraux dans les stratégies de protection des cultures. Le problème est amplifié par le retrait progressif des fongicides multisites (peu sujets aux résistances), ce qui accroît la pression sur les fongicides unisites, qui présentent un risque modéré à élevé de développement de résistance. La résistance aux fongicides n'est pas un phénomène nouveau. Dès la fin des années 1960, des cas ont été signalés, mais ils ont été largement sous-estimés car ils étaient apparus après des décennies d'utilisation. La donne a changé à partir des années 1970, où les cas de résistance sont devenus plus fréquents et beaucoup plus rapides à apparaître après la commercialisation des produits. L'exemple le plus frappant est celui du bénomyl, pour lequel une résistance est apparue après seulement deux ans d'utilisation, un phénomène qui s'est répété pour d'autres familles de fongicides. L'objectif de cette revue n'est pas de répéter ce qui est déjà bien documenté dans des ouvrages de référence existants. Son ambition est de synthétiser et de discuter l'état actuel des connaissances sur la résistance aux fongicides pour en faire une ressource accessible et informative, destinée prioritairement aux conseillers, agronomes et producteurs sur le terrain. En résumé, cette revue de littérature vise à fournir une synthèse pratique et actuelle sur le défi urgent de la résistance aux fongicides, en s'adressant directement aux acteurs du monde agricole qui doivent y faire face. Lire la suite

Laissez-vous aider par des conseillers d’expérience. Le service mentorat en horticulture maraîchère et fruitière vous permet de bénéficier de l’accompagnement personnalisé d’un expert pour vous appuyer. Découvrez nos conseillers mentors prêts à partager leur savoir-faire : Denis Giroux (horticulture conventionnelle et biologique) Maxime Brière (pommes de terre) Sébastien Martinez (pommes de terre) Nadia Surdek (horticulture conventionnelle et biologique) Julien Brière (pommes de terre et petits fruits) Anne Weill (horticulture biologique) Isabelle Turcotte (pomiculture et viticulture) Gaëlle Dubé (viticulture) Sophie Guimont (horticulture biologique) Bon à savoir : le temps que vous consacrez au mentorat, en rencontres individuelles avec votre mentor ou lors d’activités collectives, est reconnu comme formation continue par l’Ordre des agronomes du Québec. Inscrivez-vous au service de mentorat pour profiter des conseils d’un expert selon vos besoins, à votre rythme, tout en bonifiant votre dossier de formation. Accédez à la plateforme dédiée. Ce projet est financé par l’entremise du Programme services-conseils, en vertu du Partenariat canadien pour une agriculture durable, entente conclue entre les gouvernements du Canada et du Québec. Lire la suite

Avec les changements climatiques, l’irrigation devient un enjeu majeur pour l’agriculture. À terme, quasiment toutes les cultures horticoles, maraîchères et fruitières du Québec pourraient en dépendre. Le mentorat vous offre une opportunité unique d’être accompagné par un conseiller expérimenté, qui vous guidera dans l’acquisition de cette compétence essentielle. Ne manquez pas l’occasion d’enrichir vos connaissances. Inscrivez-vous dès aujourd’hui au service de mentorat en irrigation des cultures. Les places sont limitées. Accédez à la plateforme dédiée. Daniel Bergeron est agronome spécialisé en irrigation et consultant dans ce domaine. Il détient un baccalauréat en bio-agronomie et une maîtrise en sol et environnement de l’Université Laval. Ce dernier a déjà travaillé au MAPAQ en tant qu’agronome spécialisé en horticulture et plus spécifiquement en irrigation des cultures. À ce chapitre, il a réalisé et participé à plusieurs projets de gestion et d’approvisionnement en eau d’irrigation. Aujourd’hui, M. Bergeron conseille plusieurs entreprises horticoles dans l’objectif d’améliorer leur gestion de l’irrigation. Pour ce faire, il évalue la ressource eau (quantité et qualité) et effectue des analyses et recommandations qui ont trait au choix et à l’utilisation optimale des équipements et à la régie. Profitez de ses services! Par sa grande expérience, il saura vous aider à acquérir de nouvelles connaissances dans ce domaine. Des visites au champ, des formations, des ateliers d’échange sont prévus dans le cadre de son accompagnement. Voyez ses distinctions. Ce projet est financé par l’entremise du Programme services-conseils, en vertu du Partenariat canadien pour une agriculture durable, entente conclue entre les gouvernements du Canada et du Québec. Lire la suite

Nouvelles homologations - Été 2025