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06 novembre 2025
Ce projet a consisté à répondre à l’objectif principal qui vise à évaluer la capacité d’identifier par séquençage à haut débit (SHD) des organismes phytopathogènes bactériens et fongiques qui infectent des pommes de terre et des plantes en grandes cultures, et en cultures maraîchères.  En partenariat avec le Laboratoire d’expertise et de diagnostic en phytoprotection du MAPAQ (LEDP) et le Laboratoire de phytopathologie du CEROM, nous avons obtenu et traité des échantillons provenant de nos partenaires entre 2019 et 2022. Nous avons validé les protocoles d’extraction d’acides nucléiques nécessaires selon le type d’échantillon, développé les protocoles de séquençage haut débit sur plateforme MiSeq et MinION (Livrable L3). Au total cinq systèmes de détection ont été retenus pour l’évaluation sur MiSeq et deux systèmes sur MinION. Des tests additionnels ont également permis d’évaluer l’approche NanoMiSeq permettant de soumettre moins d’échantillons en même temps à la phase de séquençage. Cette approche sera plus adaptée au débit analytique du LEDP en saison estivale. Nous avons de plus évalué une approche de préparation de librairie en une seule étape qui permet de réduire les coûts d’opération reliés à l’analyse par SHD. Nous avons également développé un nouvel outil informatique permettant de créer des bases de références taxonomiques en regroupant des séquences de plusieurs bases de données de référence publiques et selon le système d’amplification utilisé pour le SHD. Cet outil (ASVMaker) a été publié dans la revue « Plants » (Annexe 2-4). La base de données taxonomiques de référence spécifiques produite avec cet outil s’intègre dans notre stratégie de double identification (application pour les données obtenues par MiSeq et NanoMiSeq) Nos résultats montrent un fort potentiel des approches SHD pour identifier les genres pathogéniques ciblés (Livrable L2). Pour certains d’entre eux (essentiellement des genres fongiques), il est possible d’identifier des Lire la suite

Mise à jour

06 novembre 2025
Cette revue de littérature se positionne dans un contexte où les fongicides chimiques, malgré les efforts pour en réduire l'usage, restent centraux dans les stratégies de protection des cultures. Le problème est amplifié par le retrait progressif des fongicides multisites (peu sujets aux résistances), ce qui accroît la pression sur les fongicides unisites, qui présentent un risque modéré à élevé de développement de résistance. La résistance aux fongicides n'est pas un phénomène nouveau. Dès la fin des années 1960, des cas ont été signalés, mais ils ont été largement sous-estimés car ils étaient apparus après des décennies d'utilisation. La donne a changé à partir des années 1970, où les cas de résistance sont devenus plus fréquents et beaucoup plus rapides à apparaître après la commercialisation des produits. L'exemple le plus frappant est celui du bénomyl, pour lequel une résistance est apparue après seulement deux ans d'utilisation, un phénomène qui s'est répété pour d'autres familles de fongicides. L'objectif de cette revue n'est pas de répéter ce qui est déjà bien documenté dans des ouvrages de référence existants. Son ambition est de synthétiser et de discuter l'état actuel des connaissances sur la résistance aux fongicides pour en faire une ressource accessible et informative, destinée prioritairement aux conseillers, agronomes et producteurs sur le terrain. En résumé, cette revue de littérature vise à fournir une synthèse pratique et actuelle sur le défi urgent de la résistance aux fongicides, en s'adressant directement aux acteurs du monde agricole qui doivent y faire face. Lire la suite
Portrait technico-économique - Production spécialisée de légumes-racines au Québec 2022
19 juin 2025
Portrait technico-économique - Production spécialisée de légumes-feuilles au Québec 2022
19 juin 2025
Portrait technico-économique - Concombre 2019
19 juin 2025

Évènements en vedette

  
Le canola d’automne : une culture à considérer Série de webinaires en gestion intégrée des ennemis des cultures (GIEC)
 Le canola d’automne : une culture à considérer Le jeudi 27 novembre 2025

La gestion intégrée des ennemis des cultures (GIEC) consiste en une démarche de lutte efficace, menée en plusieurs étapes. Cette série de webinaires portant sur la GIEC est destinée prioritairement aux conseillers et conseillères de première ligne. Différentes techniques de GIEC, prêtes à être adoptées sur les entreprises agricoles, seront présentées en détail par les experts du secteur horticole et/ou des grandes cultures. L’adoption de la GIEC dans la démarche professionnelle et dans les façons de faire des producteurs et productrices agricoles peut contribuer favorablement à la réduction de l’usage des pesticides ainsi que des risques qui y sont liés.   Jeudi 27 novembre 2025   -  Webinaire de 9 h à 10 h Le canola d’automne : une culture à considérer Hélène Brassard, agr., M. Sc., conseillère en grandes cultures et agriculture durable, MAPAQ Sébatien Boquel, Ph. D., chercheur en entomologie, CÉROM La conférence abordera la capacité du canola d’automne à éviter les dommages d’insectes, à compétitionner les mauvaises herbes ainsi que sa survie à l’hiver. Lire la suite

Santé des sols - Pourquoi s'y engager? Le mercredi 10 décembre 2025

C’est une occasion unique de comprendre les enjeux derrière cette problématique et de trouver des solutions concrètes, adaptées à la réalité de chacune et de chacun. En participant à ce rendez-vous, vous aurez l’occasion de discuter des causes de cette dégradation, mais surtout de réfléchir, avec des collègues, à des solutions appropriées pour améliorer la santé de vos sols. La santé des sols : un enjeu fondamental! Saviez-vous que la qualité de vos sols se dégrade rapidement et qu’il s’agit d’une menace pour l’avenir de vos cultures? Au Québec, la détérioration des sols agricoles est une réalité qui s’intensifie chaque année. Il est donc urgent d’agir aujourd’hui pour garantir demain. Pourquoi se mobiliser? Parce que la santé des sols est essentielle à la rentabilité des fermes, mais aussi à la durabilité de votre travail. La dégradation des sols affecte non seulement la biodiversité et l’écologie des sols, mais aussi  le rendement des cultures. Au programme : Des conférences inspirantes sur des thèmes essentiels : équilibre des éléments nutritifs, vie microbienne du sol, effets de la compaction des sols, importance de mesurer les problèmes, rentabilité des pistes de solutions, etc. Des ateliers interactifs pour échanger sur les impacts agronomiques, économiques et environnementaux de la dégradation des sols et pour définir ensemble des solutions pratiques. L'objectif? Se conscientiser collectivement et se donner des outils pour agir dès maintenant. Vous repartirez avec des pistes d'action concrètes, développées lors des discussions avec vos pairs et adaptées aux différents types de sols et de cultures. Joignez-vous à nous le mercredi 10 décembre 2025 à Drummondville. Lire la suite

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