Vous avez manqué l'édition 2017 du Colloque sur la pomme de terre? Voici l'ensemble des informations présentées lors de cette journée ainsi que les différents contenus qui ont été rendus disponibles. Programme de la journée (textes, PowerPoint et vidéos) Quantification et détermination du risque lié aux pathogènes du sol pour les pommes de terre Samuel Morissette, M.Sc., agronome, conseiller, Groupe Pousse-Vert, Saint-Arsène Hervé Van der Heyden, Ph.D., directeur scientifique, Phytodata, Québec Résultats sur la quantification et la détermination du risque lié aux pathogènes du sol par PCR quantitatif. Cette conférence s'inscrit dans la poursuite de projets depuis 5 ans sur l'emploi d'outils biomoléculaires pour la tache argentée, la gale poudreuse, la dartrose et la verticilliose. Elle implique aussi l'IRDA pour le suivi des pathogènes sur les tissus de pommes de terre. - Présentation PowerPoint   Visionner   Quantification et détermination du risque lié aux pathogènes du sol pour les pommes de terre Cette conférence est disponible sur le catalogue du CRAAQ Durée : 30 minutes     Fumigation des sols avec la chloropicrine pour la production de pommes de terre Chad Hutchinson, Ph.D., directeur de recherche, TriEst Ag Group, Inc., Floride Description de la méthodologie de traitement et son impact sur la suppression des maladies et la santé du sol. - Présentation PowerPoint   Dans cette conférence, monsieur Hutchinson aborde le sujet de la fumigation des sols avec la chloropicrine pour la production de pommes de terre. Un bref historique de l’utilisation de la chloropicrine est présenté ainsi que son impact sur la suppression des maladies et la santé du sol.   Visionnez-la gratuitement sur Agri-Réseau Indicateurs biologiques de santé et de productivité de sols en culture de pommes de terre Richard Hogue, Ph.D., chercheur-biologiste, Institut de recherche et de développement en agroenvironnement (IRDA), Québec Les résultats d'un récent projet Lire la suite

L'objectif principal de ce projet a été de développer une méthodologie de détection moléculaire rapide, fiable et sensible qui assure l’identification des virus des framboisiers et des fraisiers. Ce processus de détection et d’identification des virus (PDIV) combine les techniques de SHD à des outils d’analyses bio-informatiques pour aider le phytopathologiste à faire un diagnostic. Les techniques SHD peuvent être basées sur la plateforme NextSeq d’Illumina ou MinION d’ONT selon des considérations techniques, économiques et d’efficacité diagnostique. Les objectifs spécifiques du projet ont été de : ? Développer une collection d’échantillons de fraisiers et de framboisiers sains et virosés ainsi que de séquences génomiques de chaque virus ciblé; ? Comparer l’efficacité des méthodes diagnostiques ELISA et RT-PCR actuellement utilisées par le LEDP à celles d’un PDIV basé sur des techniques SHD. Ultimement, le PDIV conduira au développement d’un outil d’aide à la décision (OAD) pour le diagnosticien; ? Comparer les coûts d’implantation et d’utilisation des méthodes diagnostiques actuellement utilisées par le LEDP à ceux du PDIV + OAD; ? Former le personnel du LEDP et d'autres utilisateurs potentiels à l’emploi du PDIV, de sa base de données et de son interface conviviale, l’OAD. Lire la suite

Vous trouverez en hyperlien le Bulletin de recherche et développement 2000-2005 du Réseau canadien de recherche sur les bactéries pathogènes du porc. Le Réseau a été le premier effort de recherche collectif regroupant des spécialistes sur les maladies bactériennes porcines à travers le Canada. Le principal objectif du Réseau a été d'établir une collaboration nationale qui a permis de partager les connaissances et expertises dans le but de développer de nouveaux produits destinés à améliorer la santé des troupeaux de porcs canadiens. Lire la suite

Ce projet a consisté à répondre à l’objectif principal qui vise à évaluer la capacité d’identifier par séquençage à haut débit (SHD) des organismes phytopathogènes bactériens et fongiques qui infectent des pommes de terre et des plantes en grandes cultures, et en cultures maraîchères.  En partenariat avec le Laboratoire d’expertise et de diagnostic en phytoprotection du MAPAQ (LEDP) et le Laboratoire de phytopathologie du CEROM, nous avons obtenu et traité des échantillons provenant de nos partenaires entre 2019 et 2022. Nous avons validé les protocoles d’extraction d’acides nucléiques nécessaires selon le type d’échantillon, développé les protocoles de séquençage haut débit sur plateforme MiSeq et MinION (Livrable L3). Au total cinq systèmes de détection ont été retenus pour l’évaluation sur MiSeq et deux systèmes sur MinION. Des tests additionnels ont également permis d’évaluer l’approche NanoMiSeq permettant de soumettre moins d’échantillons en même temps à la phase de séquençage. Cette approche sera plus adaptée au débit analytique du LEDP en saison estivale. Nous avons de plus évalué une approche de préparation de librairie en une seule étape qui permet de réduire les coûts d’opération reliés à l’analyse par SHD. Nous avons également développé un nouvel outil informatique permettant de créer des bases de références taxonomiques en regroupant des séquences de plusieurs bases de données de référence publiques et selon le système d’amplification utilisé pour le SHD. Cet outil (ASVMaker) a été publié dans la revue « Plants » (Annexe 2-4). La base de données taxonomiques de référence spécifiques produite avec cet outil s’intègre dans notre stratégie de double identification (application pour les données obtenues par MiSeq et NanoMiSeq) Nos résultats montrent un fort potentiel des approches SHD pour identifier les genres pathogéniques ciblés (Livrable L2). Pour certains d’entre eux (essentiellement des genres fongiques), il est possible d’identifier des Lire la suite

Mettre au point des tests de diagnostic afin d'évaluer correctement les populations d'agents pathogènes terricoles afin d'aider les producteurs à ne pas recourir à l'épandage de pesticides coûteux et inutiles.

Guide de gestion des risques agricoles est un document de référence utile pour les gestionnaires d'entreprises agricole qui désirent être outillés contre les risques inhérents à la gestion de leur entreprise, et qui veulent y réagir. Ce document identifie six catégories de risques : les risques de production, les risques des ressources humaines, les risques de mise en marché, les risques des politiques publiques, les risques juridiques et les risques financiers auxquels les producteurs canadiens sont confrontés, et il suggère des façons d'y remédier. Lire la suite